Damit Bakterien und andere mikroskopische Organismen Stickstoff und Phosphor assimilieren können, muss Kohlenstoff in ausreichender Menge vorhanden sein.
Mit der zunehmenden Effizienz von Filtersystemen werden Aquarien mit niedrigem und extrem niedrigem Nährstoffgehalt immer häufiger. Diese Systeme sind oft kohlenstoffarm. Wenn ein System kohlenstoffarm ist, bedeutet dies, dass die "biologische Filterung" nicht so effizient abläuft, wie sie sollte, und dass Nährstoffe wie NO3 und PO4 wahrscheinlich ansteigen und zu Schadstoffen werden, wenn nicht andere Formen der Filterung eingesetzt werden.